南京中醫藥大學始建於1954年10月15日，初名江蘇省中醫進修學校，後經江蘇省中醫學校，擴建為南京中醫學院，1995年經國家教育部批准正式更名為南京中醫藥大學，發展至今已歷經了半個世紀的歲月洗禮，是全國建校最早的高等中醫藥院校之一。
歷史
建校之初，學校為落實毛澤東同志提出的“中醫藥學是一個偉大的寶庫，應當努力挖掘加以提高”和當時國家的衛生工作方針，在浩如煙海的古籍中積極挖掘、整理和編寫了新中國高等中醫教育第一套教材和教學大綱，培養和輸送了以董建華、程莘農為代表的第一批師資，接受並培養了第一批外國中醫留學生，誕生了承淡安、葉橘泉等一批新中國中醫藥界最早的學部委員，為新中國現代中醫高等教育模式的確立和推廣做出了重要貢獻，被譽為“高等中醫教育的搖籃”。
辦學特色
半個世紀中，學校一貫堅持以中醫藥為主體的辦學特色，始終如一地秉承“嚴謹治學”、“繼承創新”的優良傳統，按照科學發展觀的要求，根據自身條件與辦學潛力，立足江蘇，面向全國，放眼世界，主動服務社會、地方經濟及整個中醫藥行業發展需要，取得了顯著的辦學成果，現已建設成為隸屬於江蘇省政府的教學研究型重點高校。
院所設置
學校現設有基礎醫學院、藥學院、第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、經貿管理學院、護理學院、外國語學院、資訊技術學院、翰林學院、高等職業技術學院、成人教育學院和國際教育學院（港澳臺培訓中心）等 12所學院；有省級教學實驗示範中心建設點5個：有江蘇省中醫院、江蘇省第二中醫院、南京市中醫院、常州市中醫院、無錫市中醫院、徐州市中醫院、蘇州市中醫院和昆山市中醫院共8所附屬醫院，以及中西醫結合臨床醫學院（南京市鼓樓醫院）1所，有教學醫院近20所，教學及畢業實習基地近100個，實現了萬人大學的規模。學校擁有15個本科專業，30餘個專業方向，涵蓋醫、管、理、工、經、文等多個學科門類，初步形成了以中醫藥為主體，多學科相互滲透、優勢互補、協調發展的辦學格局，建成中醫內科學、中醫外科學等10餘門省級以上優秀課程，溫病學、中醫兒科學還被列入國家精品課程，大批特色專業和品牌專業不斷湧現，綜合辦學實力穩步發展。
