學校注重以重點學科建設為龍頭，促進科技學術創新，現有一級學科國家重點學科1個、二級學科國家重點學科5個、國家中醫藥管理局重點學科10個、一級學科廣東省重點學科2個、二級學科廣東省重點學科1個，其中中醫學、中西醫結合、中藥學在全國一級學科整體評估中依次名列第一、第三、第五。有科技部工程中心5個，部局級重點實驗室21個，形成復方青蒿素防治瘧疾、中醫藥干預SRAS、脾胃學說、骨關節疑難病防治、愛滋病防治、南藥資源開發等優勢領域，近5年獲科研資助1950多項，資助經費過3.2億元，科研成果獲省部級以上科技成果獎80項。主辦《新中醫》、《廣州中醫藥大學學報》、《中藥新藥與臨床藥理》3本中文核心期刊和統計源期刊。
學校有直屬附屬醫院4所、與企業合辦醫院1所、非直屬附屬醫院17所，教學醫院涵蓋廣東省內絕大多數大中型中醫院及鄰省部分中醫院。第一、二、三附屬醫院形成以20個國家重點專科為龍頭的專科專病技術群，綜合實力居全國前茅，無償救治好軍嫂韓素雲享譽全國，抗擊SARS聞名全球，開創在香港公立醫院設立中醫臨床研究中心先河，2009年門診821萬人次、出院9.2萬人次。
學校從1974年開始招收港澳台外國留學生，先後與50多個國家和地區建立友好合作關係，接待101個國家和地區的訪問團體（個人），已有113個國家和地區的學生來校學習，成為輻射全球多個國家和地區的中醫藥學術和教育中心。近年來牽頭舉辦穗台港澳中醫藥資訊交流會和泛珠三角區域高等中醫藥院校合作發展聯席會，建立廣東中醫藥博物館等中醫藥文化基地並入選全國科普基地，已成為中醫藥海外傳播重要窗口。秉承“厚德博學、精誠濟世”的校訓，廣州中醫藥大學正在建設廣東中醫藥強省、發展中醫藥學術、造福全人類健康中發揮越來越大的作用。
